Глобальные ниши прокариотов: поверхность тела и пищеварительный тракт животных

Наружная поверхность тела и пищеварительный тракт животных всегда колонизированы прокариотами. В первом случае это преимущественно аэробные организмы, тогда как во втором случае преобладают факультативно анаэробные и облигатно-анаэробные формы.

Общее число обитателей данной ниши составляет 5,3-10²⁴ клеток. В целом ее можно рассматривать как благоприятную, но высоко элективную, что в первую очередь связано с природой накапливающихся в ней субстратов.

В частности, pH нормальной кожи человека лежит в кислой области (4,2-5,6), а ее поверхностные слои обогащены катионами Са₂₊ и анионами С_1-. Среди секретируемых субстратов преобладают липиды.

Число бактерий в нормальном кишечнике человека, рогатого скота, домашней птицы и насекомых на порядки больше, чем их содержится на наружной поверхности тела. Главные обитатели пищеварительного тракта травоядных животных — это компоненты анаэробного деструктивного сообщества (целлюлолитические бактерии, кислотообразующие бактерии-бродилыцики, ацетогенные бактерии и метаногенные археи).

В разных отделах пищеварительного тракта человека преимущественно размножаются ацидофильные или умеренно алкалифильные бактерии. Доминирующей формой является род Bacteroides.

При инфицировании покровов, пищеварительного тракта, полости тела и отдельных органов в них развиваются специфические формы бактерий.