Глобальные ниши прокариотов: поверхность растений

К числу глобальных ниш относится поверхность корней и листьев растений, а также примыкающий к ней слой почвы или воды.

Ризосфера и ризоплана. По методическим причинам свободноживующие формы почвенных бактерий трудно подсчитать отдельно от бактерий, которые тесно взаимодействуют с корневой системой. Поэтому их обычно суммируют.

Между бактериями, ассоциированными с корневой системой растения, и макроорганизмом устанавливается встречный сигналинг, итогом которого становится тесное трофическое взаимодействие. Бактерии ризосферы (греч. rhiza — корень и sphaira —шар; «пространство, окружающее корень») расположены на удалении от поверхности корня, а бактерии ризопланы (греч. rhiza —корень и лат. planites — плоскость; «поверхность корней») прикреплены к ней.

Некоторые бактерии ризосферы и ризопланы проявляют фитопатогенные свойства и могут проникать внутрь растения (например, Pseudomonas solanacearum).

Филлосфера. Листья наземных и водных растений колонизированы бактериями. В обоих случаях используется стандартный термин «филлосфера» (греч. phyllon —лист и sphaira — шар; «пространство, окружающее лист»), хотя на самом деле он применим только к водным растениям. К сожалению, почти не употребляется термин «филлоплана» (греч. phyllon — лист и лат. planites — плоскость; «поверхность листьев»), хотя он относится к обеим группам растений.

Поверхность листьев наземных растений представляет собой экстремальную нишу, поскольку она подвергается частой смене температур и влажности и в норме предоставляет мало субстратов для роста бактерий. Чаще всего филлосферные бактерии являются безвредными эпифитами, тогда как другие обладают факторами фитопатогенности и могут проникать внутрь растения, переходя в эндофитное состояние (например, Р. syringae).