Разнообразие прокариотов

В настоящий момент определены полные последовательности гена 16S рРНК примерно для 1,5 • 10⁴ культивируемых бактерий и архей. Для фантомных прокариотов число выявленных последовательностей вдвое больше (примерно 3 • 10⁴).

Начиная с 1996 г. число выявляемых фантомных объектов стало увеличиваться экспоненциально (только в 2002 г. в GenBank были депонированы 9 • 10³ новых последовательностей) .

В настоящее время известны 52 бактериальные филы. Из них 26 актуалистические (примерно 5 • 10³ законных видов), остальные 26 —это фантомные объекты.

В I томе «Руководства Берги по систематике бактерий» (2001 г.) упоминаются только 23 актуалистические бактериальные филы. Статус некоторых из них окончательно не определен, и в будущем они могут быть «поглощены» другой филой или, напротив, могут «отпочковать» от себя новую филу.

Например, в роли претендентов на ранг новой филы рассматривается термофил Caldithrix abyssi, описанный в 2003 г. М. Л. Мирошниченко с соавторами, а также термофилы Desulfurobacterium и Coprothermobacter, отнесенные в I томе «Руководства Берги по систематике бактерий» (2001 г.) к филам Aquificae и Firmicutes.

В свою очередь, в настоящее время выявлены четыре археотные филы. Три из них актуалистические (примерно 220 законных видов), четвертая фила — это фантомные объекты.

Каковы сегодняшние прогнозы в отношении общего числа видов бактерий и архей? С учетом криптических форм оно оценивается в 5-106 (вчетверо больше общего числа видов протистов, грибов, животных и растений). Называются и гораздо более крупные цифры —до 109, хотя они, скорее всего, преувеличены.