Геном ВИЧ

Геном ВИЧ состоит из 9 генов, часть из которых перекрывается концами (имеет несколько рамок считывания) и имеет экзонинтронную структуру. Они контролируют синтез 9 структурных и 6 регуляторных белков.

Значение LTR для вирусного генома заключается в том, что в них расположены следующие регуляторные элементы, контролирующие его работу:
а) сигнал транскрипции (область промотора);
б) сигнал добавления поли-А;
в) сигнал кэпирования;
г) сигнал интеграции;
д) сигнал позитивной регуляции (TAR для белка ТАТ);
е) элемент негативной регуляции (NRE для белка NEF);
ж) участок прикрепления затравочной РНК для синтеза минус-цепи ДНК на З'-конце; сигнал на 5'-конце LTR, который служит затравкой для синтеза плюс-цепи ДНК.

Кроме того, в LTR имеются элементы, участвующие в регуляции сплайсинга мРНК, упаковки молекул вРНК в капсид. Наконец, при транскрипции генома в длинных мРНК образуются два сигнала для белка REV, которые переключают синтез белков: CAR — для регуляторных белков и CRS — для структурных белков. Если белок REV связывается с CAR, синтезируются структурные белки; если он отсутствует, синтезируются только регуляторные белки.

В регуляции работы генома вируса особенно важную роль играют следующие гены-регуляторы и их белки:
1) белок ТАТ, который осуществляет позитивный контроль размножения вируса и действует через регуляторный участок TAR;
2) белки NEV и VPU, осуществляющие негативный контроль размножения через участок NRE;
3) белок REV, осуществляющий позитивно-негативный контроль.

Белок REV контролирует работу генов gag, pol, env и осуществляет негативную регуляцию сплайсинга. Таким образом, размножение ВИЧ находится под тройным контролем — позитивным, негативным и позитивно-негативным.

Белок VIF определяет инфекционность вновь синтезированного вируса. Он связан с капсидным белком р24 и присутствует в вирионе в количестве 60 молекул. Белок NEF представлен в вирионе небольшим числом молекул (5—10), возможно, связанных с оболочкой.

Белок VPR тормозит клеточный цикл на фазе G2, участвует в транспорте преинтеграционных комплексов в ядро клетки, активирует некоторые вирусные и клеточные гены, повышает эффективность репликации вируса в моноцитах и макрофагах. Место расположения белков VPR, ТАТ, REV, VPU в вирионе не установлено.

Помимо собственных белков в состав оболочки вириона могут входить некоторые белки клетки-хозяина. Белки VPU и VPR участвуют в регуляции репродукции вируса.